开发一个全港性、以病人为本的电子健康系统（医健通），是2008年3月发表的医疗改革谘询文件《掌握健康， 掌握人生》所载的服务改革建议之一。在各项服务改革建议中，这项建议于谘询期间获得市民广泛支持。前食物及卫生局在2009年设立电子健康纪录统筹处，以落实既复杂又涉及多方面事宜的医健通发展计划。
第一阶段发展计划
医健通的发展分为两个阶段。立法会于2009年7月批准为数7.02亿港元的新承担额，用以推行为期五年的第一阶段医健通计划。第一阶段发展的目标为：
建立医健通作为一个重要的医护基础建设，连接所有参加医健通的公立及私家医院；
确保市场上提供连接至医健通的电子病历／电子医疗纪录系统或其他健康资讯系统，让医护机构应用；及
在医健通启用前，为系统制订法律框架，以保障资料私隐及保安。
随后，医健通核心部件，标准化和界面衔接部件发展完成，并制订了专门规管医健通的法例（互通系统条例）。医健通于2016年3月13日正式启用，供医护机构及市民登记参加。
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1. 法律及私隐
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时间表
制订法律、私隐及保安框架
2009年至2012年第二季
草拟电子健康纪录条例草案
2012年第二季至2013年
立法程序
2014年至2015年
私隐影响评估
2010年至2014年
2. 医健通核心发展
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时间表
医健通核心互通基础设施
2009年年中至2014年
临床医疗管理系统的基本适配 (供私家医院使用)
2009年年中至2014年
临床医疗管理系统连接 (供私家医生使用)
2009年年中至2014年
信息标准化
2009年至2014年
3. 医健通协作计划
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时间表
医健通协作计划及协作项目
2009年至2015年
4. 互联试验计划
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时间表
公私营医疗合作－ 医疗病历互联试验计划
2009年至2015年
放射图像互通试验计划
2009年至2015年
5. 医健通啓用
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时间表
医健通啓用
2016年
第二阶段发展计划
随着第一阶段医健通发展计划运作畅顺，立法会于2017年3月批出4.22亿元非经常拨款予为期五年的第二阶段计划。在第二阶段发展计划下，医健通已于2017至2022年完成主要工作如下：
扩大可互通资料范围及开发互通放射影像和中医药资料的技术；
方便医护接受者使用医健通；及
改善及加强核心功能和保安／私隐保障。